Hola BetoxCNC, según tu descripción entiendo que se te daño el acople flexible (pieza de aluminio) ???? creo, si es así y la apretaste para salir del apuro, pareciera que la flexibilidad de dicha pieza se perdió, si la alineación entre el motor y la varilla del eje esta ligeramente desviada genera cierto estrés que se trasmitirá al motor que puede dejar de trabajar si supera el torque o par máximo, si esto es así pueda que también tengas una ligera vibración o ruido resultante del esfuerzo, si todo lo anterior es correcto tendrás que reemplazar el acople por uno similar al original pues esa flexibilidad compensa desviaciones de alineación de tu motor con respecto al sistema de tracción, en tu caso la varilla.
Si la pieza afectada no es acople flexible seria bueno ver alguna fotos para poder colaborarte mejor. Espero te sirva de algo. Cordial saludo.