Pon alguna foto para que podamos ver como la estas fabricando y poderte orientar mejor.
Las maquinas aunque lleven un solo motor llevan guias a los dos lados con correas a los dos lados y un eje acoplado al motor con rodamientos todo lo largo que es la maquina así no debería vibrar.
Si pones un motor a un lado y al otro nada es nornal que vibre e incluso que se atasque y no se mueva.