¿El cable que estas utilizado es blindado?

Si utilizas cable blindado para los encoders esto puede solucionar tu problema.

Tambien revisa si estos cables pasan cerca de cables de "Fuerza" osea cables que alimentan a tus fuentes o tu router, ya que son estos los que generan la mayor parte del ruido electrico.

Es una buena practica separar los cableados de "Fuerza" (Alimentación de router o los cables de la cortadora de plasma) de los de control (Switch de home/stop encoders y todos los que manejan 5 VCC). De ser posible canalizar por tuberias conduit los cables de Fuerza, esto es dificil por lo que es una solución mas practica utilizar cable blindado (Tiene una malla de cobre entre el aislante del cable y un segundo aislante exterior).

Los motores paso a paso utilizan ondas cuadradas para su funcionamiento, por lo que los cables que los alimentan tambien deberian ser blindados para evitar una deformación de las ondas que afecten al funcionamiento de los motores.

V.H.