una pregunta viendo la maquina de frente donde referencia, arriba a la izquierda o abajo a la derecha, o sea donde tenes el X0 e Y0, podes darme datos, otra pregunta hiciste el diseño a pie de maquina o con algun soft, me da simplemente la impresión por lo que contas que moverte en negativo
Proba

G1 Z-100
X-100
Z 0
X 0

Haber si te hace un cuadrado de 100 x 100 mm