Ese es el lado lógico de la placa, en la documentación debe decir para qué sirven esos pines, pero al ojo diría que son para deshabilitar uno o más ejes en caso de no usarlos, uniendo uno o más al COM que tienen al lado. Lo único que tengo claro es que no debes conectar ningún motor ahí, ese COM no tiene nada que ver con el de los motores.
Esa controladora es bipolar, así que no puedes conectar el motor en modo unipolar. Como el motor es de 8 cables puedes conectarlo en modo bipolar serie o bipolar paralelo de acuerdo a la imagen que posteaste anteriormente. Unipolar paralelo por lo general da mejor rendimiento pero requiere mayor corriente. Fíjate bien en la configuración de corriente de los drivers antes de conectar los motores, especialmente si usas bipolar serie ya que ahí el motor requiere menos corriente y si le tiras mucha se puede quemar.