desconozco ese soft, pero seguro que tiene algun parámetro para configurar los motores y el paso del tornillo, podes jugar con esos valores, siempre chequea luego de ajustar los valores con un comparador o calibre fijado a la mesa si la distancia que mandas a mover es la que marca, eso hacelo en los 2 sentidos, inclusive podes hacerlo antes de tocar ningun valor para ver cual es el eje que tiene resbalamiento o si son ambos..