Tienes razon, el cambio mas dificil de hacer en tu proyecto es el de mentalidad, de hai en fuera no hay mayor problema.
El DOM que se te quemo es solo la parte equivalente a un disco duro en un "PC tradicional", aunque en realidad como ya te comente, tu controlador es una PC, con procesador, memoria RAM, tarjeta de video integrada, puertos (los que ya me dijiste), etc. solo que su software (en la DOM) esta diseñado para correr en DOS, inmagina que lo unico que se haria es un actualizacion a la PC, por una mas moderna, pero ahora el sofware corre en windows, es lo mismo.
De cualquier manera, estoy esperando respuesta de un amigo con respecto a lo de crear un clon de la otra DOM, en cuanto me informe te lo hago saber.
Edgar