Muy buen trabajo Mentus, esta quedando todo muy lindo.

La c4 la probe, y funciona bien, es una controladora simple, no cuenta con control de corriente, y puede que alimentando tus motores con 12V siendo de 6-8V como dijiste lleguen a calentar un poco. De todas formas si calientan puedes alimentarlos con 5V de la misma fuente.

Respecto al agregar unos capacitores, en ese tipo de fuente es innecesario, estas fuentes conmutadas tienen muy buenos filtros y el porcentaje de riple es muy chico, no es necesario para nada. Lo que no se que hace ese transformador ahí, o la fuente de pc es solo pra tener los 5v de la lógica y con el trafo mas un puente de diodo ibas a obtener la continua para los motores, en ese caso si vas a necesitar un capacitor.

Saludos