Hola Pablo, ante todo te felicito por la ganas que le estas poniendo al proyecto y gracias por la mencion sobre las poleas.

Con respecto al tema de posicionar el husillo, como dice el amigo Gerardo, mach lo que tiene es una entrada INDEX que se usa para sensar la velocidad, con esto permite la realizacion de roscas, pero no una parada exacta.

No te queda otra que meter un servo para esta operacion.
La idea de usar un PaP para posicionar y el motor que tenes para velocidad es buena, tendrias que resolver el tema del acople mecanico, podria utilizarce algun embrage magnetico para acoplar el PaP, ya que no es bueno hacerlo andar libre a altas velocidades cuando estes usando el otro motor.

Saludos y exitos,