Eje Z pierde coordenadas y rompe las piezas

Hola Chic@s, soy nuevo en este mundillo y antes de nada agradeceros que hagais esta labor de apoyo a los neofitos que nos metemos en estos berenjanles.
Tengo un Router CNC que he comprado en China marca Dwin 6090 con controlador RichAuto, con una mesa de trabajo de 1500mm x 600mm. La uso para mecanizado de plantillas ortopedicas fresando polipropileno. Lo hago con una fresa de punta esférica 6r 12mm de diametro, 55mm de corte y 130mm de largo total.
Despues de varios problemas de desconfiguración de parametros del controlador, que es una ...., ahora tengo un probelma que no me habia sucedido antes, al mecanizar una pieza por ambas caras, que normalmente son de un espesor de 1,8mm, el eje Z pierde la referencia del cero de mesa y se baja aproximadamente 1,67mm por lo que me parte la pieza o la debilita hasta tal punto que no sirve.
Me podeis dar alguna luz que me ayude con esto ?